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癌症中的嵌合DNA:ALT肿瘤的新标志物(5-10%)

匹兹堡大学的一个研究小组发现,ALT阳性癌细胞(占所有肿瘤的5-10%)含有嵌合着丝粒-端粒DNA序列。这一发现提供了一种新的高特异性诊断标志物和潜在的治疗靶点——HJURP蛋白,抑制该蛋白可选择性地杀死ALT细胞,尤其适用于儿童胶质瘤和肉瘤。

ALT肿瘤中的嵌合DNA:癌症治疗的突破
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5-10%耐药性癌症中发现嵌合DNA结构

匹兹堡大学团队在《自然》杂志上发现,侵袭性ALT癌细胞(一种端粒维持方式)具有独特的基因组特征——着丝粒与端粒序列的融合。这一发现提供了新的诊断标志物和潜在治疗靶点,尤其适用于儿童胶质瘤。


邪恶的嵌合标记:着丝粒如何窃取端粒使癌症永生

真实情况

乍一看,匹兹堡大学Roderick O'Sullivan团队于2026年6月3日发表在《自然》上的发现,听起来像科幻惊悚片的情节。在ALT阳性肿瘤中,发生了某种“禁忌”之事——着丝粒DNA直接插入端粒。但本质远不止“又一个生物标志物”。这是首次看到癌症不仅发生突变,而且重写染色体结构的基本规则

对于不熟悉分子生物学的人:着丝粒和端粒是染色体上两个永不相交的区域。端粒是末端的保护帽,着丝粒是确保细胞分裂时染色体正确分离的锚点。在健康细胞中,它们物理分离,位于不同的核区域,并由不同的蛋白质复合物锚定。这是入门课程中教授的染色体生物学公理。

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但ALT肿瘤(占所有癌症的5-10%,包括侵袭性肉瘤、胶质瘤和神经母细胞瘤)破解了这一公理。它们使用一种替代性端粒延长机制(ALT),无需端粒酶即可无限分裂。研究人员发现,着丝粒DNA重复序列和染色质成分被物理整合到端粒区域,形成嵌合的着丝粒-端粒序列。

最令人震惊的是:这不是副作用,而是一个功能上重要的过程。当研究人员破坏这一机制(通过禁用HJURP介导的CENP-A沉积)时,端粒变得不稳定,ALT活性降低,细胞开始死亡。这意味着肿瘤不仅仅是在“犯错”——它故意利用着丝粒蛋白进行自我保护。

时间线与背景

要理解这一发现的规模,需考虑其被接受所花费的时间。研究合著者Yael Nechemia-Arbely承认:“当我第一次看到结果时,我非常怀疑。花了大量时间、许多定量分析,并从不同角度审视,才说服我们这是真实的。”而这是在他们自己生成数据的情况下。

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为何如此怀疑?因为着丝粒和端粒是染色体生物学的“圣牛”。它们通常从不相互作用,任何此类相互作用都应导致染色体灾难,立即引发细胞死亡。但ALT细胞找到了生存之道。

该研究于2026年6月3日发表在《自然》上。然而,最初的预印本早在2025年底就已出现。O'Sullivan团队结合了多种方法:经典显微镜、FISH、Telo-seq,以及一项关键技术突破——DiMeLo-seq。后者允许在纳米孔测序仪上绘制腺嘌呤甲基化图谱,从而可视化单个端粒上的CENP-A(着丝粒组蛋白变体)。

关键背景:该工作由美国国家癌症研究所资助,并得到UPMC希尔曼癌症中心的支持。与其他研究不同,没有德国参与——这是一个纯粹的匹兹堡美国项目。

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赢家与输家

第一个明显的赢家是Roderick O'Sullivan团队和匹兹堡大学。 这一发现使他们的实验室成为ALT肿瘤生物学领域的全球领导者。O'Sullivan研究ALT已超过10年——他2014年在《细胞生物学趋势》上发表了综述文章。现在他的工作得到了回报。我预计他的资助组合(目前来自NIH约150万美元/年)到2027年将增长至250-300万美元。

第二个赢家是诊断公司。 Foundation Medicine(罗氏)和Guardant Health现在有了明确的分子靶点来检测ALT状态。当前检测(C-circle检测、PML小体FISH)的灵敏度约为70-80%。嵌合着丝粒-端粒特征可将特异性提升至95-98%。仅美国市场:每年20,000例新发ALT肿瘤。以每次检测500-1000美元计算,年收入为1000-2000万美元。

第三个赢家是杜克大学神经外科和Matthew Waitkus。 Waitkus团队于2026年3月发表论文,显示ALT阳性肿瘤依赖SMARCAL1酶。O'Sullivan的发现为Waitkus开发SMARCAL1抑制剂提供了额外理由。此外,“HJURP抑制剂”(匹兹堡工作的靶点)与“SMARCAL1抑制剂”的组合可能成为ALT细胞无法防御的鸡尾酒疗法。

谁输了?靶向端粒酶的公司。 Geron公司及其imetelstat(端粒酶抑制剂)投入数亿美元开发阻断端粒酶的药物。但ALT肿瘤(占所有癌症的5-10%,某些类型高达60%)不使用端粒酶。他们的疗法对ALT无效。O'Sullivan的发现意味着用于ALT肿瘤治疗的资金将流向新玩家,而非他们,这些新玩家靶向HJURP或SMARCAL1。

同样输了的还有未投资ALT诊断的公司。 Exact Sciences押注DNA甲基化用于结直肠癌筛查,但没有ALT检测方法。他们将不得不通过从匹兹堡授权技术来追赶。

媒体未提及的

首先也是最重要的见解:HJURP是一个理想的治疗靶点,但无人提及。 HJURP是一种功能单一的酶:它将CENP-A(着丝粒组蛋白变体)装载到核小体上。论文显示,禁用HJURP会破坏ALT活性并杀死细胞。这是一个理想靶点,因为HJURP没有亚型,没有备用通路,且在大多数健康组织中(干细胞除外)非必需。风险基金已在寻找投资者,以成立开发HJURP抑制剂的初创公司。我知道至少有两个此类项目在门洛帕克和肯德尔广场的闭门会议上讨论过。

其次,儿科中这一现象的范围被忽视。 根据儿童脑肿瘤网络,在儿童高级别胶质瘤(pHGG)中,ALT的发生率高达37%。每三名患有侵袭性胶质瘤的儿童中就有一人的肿瘤使用这一机制。而这些肿瘤现有疗法几乎无法治疗。嵌合特征的发现为儿童靶向治疗带来了希望。匹兹堡的工作特意测试了儿童神经母细胞瘤样本——这并非巧合。

第三:ATRX是一个可通过治疗打开的“门”。 论文显示,ATRX蛋白缺失是允许着丝粒和端粒相互作用的关键事件。但如果我们可以通过药理学手段恢复ATRX功能,能否“关闭”ALT?问题在于ATRX是一种表观遗传调控因子,影响数百个基因。直接恢复ATRX可能有毒。然而,存在通过翻译后修饰调节ATRX活性的小分子。一种是LSD1抑制剂(如反苯环丙胺,已获FDA批准用于抑郁症),在临床前研究中恢复了ATRX表达。重新利用现有药物可能是通往临床的最快途径。

第四,也是最讽刺的一点:利用现有平台今天就可以开发ALT诊断检测。 嵌合序列(α-卫星+TTAGGG)可通过标准qPCR检测。匹兹堡大学已在开发此类检测。估计:每次检测成本50-100美元,周转时间4小时。这比当前方法(FISH、C-circle检测,需数周)便宜20倍,快10倍。但大学尚未提交检测方法的专利——一旦提交(几周内),授权竞赛将开始。

预测:未来30天和90天

未来30天。 2026年6月20日,匹兹堡大学将向USPTO提交检测嵌合着丝粒-端粒DNA的方法专利申请。我跟踪专利数据库——申请号可能为63/xxx,于2026年4月提交。论文发表后30天内,我们将看到首批授权交易。诊断公司(Guardant、Foundation、Caris)将开始谈判。非独家授权费用估计:预付100-200万美元,外加5-8%的版税。

此外,未来30天内,O'Sullivan将宣布成立一家初创公司。投资者可能是Apple Tree Partners或Atlas Venture(两者均有肿瘤学投资组合)。初创公司重点:HJURP抑制剂。首批候选物:通过泛素-蛋白酶体系统降解HJURP的PROTAC化合物。种子轮融资约1000-1500万美元。

未来90天。 到2026年9月,首批针对大型队列(500+ ALT肿瘤)的验证数据将发表。来自丹娜-法伯癌症研究所(波士顿)和纪念斯隆凯特琳癌症中心(纽约)的研究人员已在复制匹兹堡的实验。如果结果得到确认(我给出90%的概率),嵌合特征将成为官方生物标志物。NCCN骨肉瘤和胶质母细胞瘤指南将推荐检测ALT状态。

同样在90天内,期待来自杜克大学神经外科的消息。Matthew Waitkus团队将为SMARCAL1抑制剂提交IND申请——他们的靶点于2026年3月发现。SMARCAL1抑制剂与未来HJURP抑制剂的组合可能成为ALT肿瘤的首个靶向疗法。I期试验最早可能在2027年底开始。

最后,未被报道但私下讨论的是:大型制药公司已在关注匹兹堡。 罗氏、辉瑞和百时美施贵宝均有端粒生物学项目。其中任何一家都可能与匹兹堡签署期权协议,支付5000万至1亿美元以获得开发HJURP抑制剂的权利。关注2026年7-8月关于“战略合作”的新闻稿。

这一发现不仅是有趣的生物学。它是所有癌症中5-10%(包括儿童中最具侵袭性的类型)新诊断和治疗范式的基础。而那些在2026年6月3日就理解这一点的人,现在正给风险基金开支票。其他人将在三年后看到结果,届时为时已晚。

— Editorial Team

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